Perbedaan mendasar antara tumbuhan monokotil dan dikotil itu sesuai dengan nama keduanya, yakni jumlah kotiledon (daun lembaga) yang dimiliki biji tumbuhan tersebut. Monokotil atau
Monocotyledoneae memiliki satu daun lembaga, sedangkan dikotil atau
Dicotyledoneae memiliki sepasang daun lembaga.